Uczenie maszynowe i sztuczne sieci neuronowe/Ćwiczenia 2: Różnice pomiędzy wersjami
Z Brain-wiki
Linia 83: | Linia 83: | ||
</source> | </source> | ||
--> | --> | ||
− | = | + | =Regresja liniowa jako filtr = |
− | Poniższy przykład ma nam uświadomić możliwość wykorzystania | + | Poniższy przykład ma nam uświadomić możliwość wykorzystania regresji do filtrowania sygnałów. Przy okazji nauczymy się pracy z ciągiem uczącym |
+ | <source lang = python> | ||
+ | # -*- coding: utf-8 -*- | ||
+ | #from sklearn.neural_network import MLPRegressor #http://scikit-learn.org/dev/modules/generated/sklearn.neural_network.MLPRegressor.html#sklearn.neural_network.MLPRegressor | ||
+ | from sklearn import linear_model | ||
+ | from scipy.signal import firwin, lfilter | ||
+ | import numpy as np | ||
+ | import pylab as py | ||
+ | |||
+ | def spectrum(x,Fs): | ||
+ | N = len(x) | ||
+ | P = np.abs(np.fft.fft(x))**2/len(x) | ||
+ | f = np.fft.fftfreq(len(x),1.0/Fs) | ||
+ | P = P[0:N/2] | ||
+ | P[1:-1] *=2 | ||
+ | f = f[0:N/2] | ||
+ | return f,P | ||
+ | |||
+ | sampling = 128.0 | ||
+ | rzad = 30 | ||
+ | N_wej = rzad # rozmiar bufora wejściowego | ||
+ | demo = False # czy rysować tworzenie przykładów | ||
+ | |||
+ | T = 10 # ile skund sygnału | ||
+ | t = np.arange(0,T,1/sampling) | ||
+ | #Losowy sygnał wejściowy | ||
+ | x = np.random.randn(len(t)) | ||
+ | |||
+ | # przygotowujemy dane tak aby nauczyć filtrowania dolnoprzepustowego | ||
+ | b= firwin(rzad,10.0/sampling) | ||
+ | y = lfilter(b,[1],x) | ||
+ | |||
+ | |||
+ | # tworzymy ciąg uczący | ||
+ | N_przykladow = len(x)-N_wej-1 | ||
+ | X = np.zeros((N_przykladow,N_wej)) | ||
+ | Y = np.zeros((N_przykladow,1)) | ||
+ | |||
+ | for i in range(N_przykladow): | ||
+ | X[i,:] = x[i:i+N_wej] | ||
+ | Y[i] = y[i+N_wej-1] | ||
+ | if demo: | ||
+ | py.clf() | ||
+ | py.plot(t,x,'r') | ||
+ | py.plot(t,y,'b') | ||
+ | py.plot(t[i:i+N_wej],X[i,:],'ro') | ||
+ | py.plot(t[i+N_wej-1],Y[i],'bo') | ||
+ | py.pause(1) | ||
+ | |||
+ | # tworzmy obiekt do regersji liniowej | ||
+ | model = linear_model.LinearRegression(fit_intercept=False) | ||
+ | # dopasowujemy parametry modelu | ||
+ | model.fit(X, Y) | ||
+ | |||
+ | # test na zbiorze uczącym: dla kolejnych buforów wejściowych obliczamy wartości wyjściowe | ||
+ | y_est = np.zeros(x.shape) | ||
+ | for i in range(len(x)-N_wej-1): | ||
+ | bufor_wejsciowy = x[i:i+N_wej] | ||
+ | y_est[i+N_wej-1] = model.predict(bufor_wejsciowy) | ||
+ | |||
+ | # ilustracja dopasowania modelu: | ||
+ | # - górny panel sygnał wejściowy | ||
+ | # - dolny panel sygnał otrzymany jako predykcje modelu (czerwony) na tle filtrowanego sygnału (zielony) | ||
+ | py.figure(1) | ||
+ | py.subplot(2,1,1) | ||
+ | py.plot(t,x) | ||
+ | py.title('wejscie') | ||
+ | |||
+ | py.subplot(2,1,2) | ||
+ | py.plot(t,y,'g') | ||
+ | py.plot(t,y_est,'r') | ||
+ | py.title('wyjscie') | ||
+ | |||
+ | |||
+ | # test na innym zbiorze - dajemy zestaw sinusów o losowej fazie i czestosciach 0-64Hz | ||
+ | x_test = np.zeros(len(t)) | ||
+ | faza = np.zeros(len(range(1,64,2))) | ||
+ | for i,f in enumerate(range(1,64,2)): | ||
+ | faza[i] = np.random.rand(1)*2*np.pi | ||
+ | x_test += np.sin(2*np.pi*f*t + faza[i]) | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | y_test = lfilter(b,[1],x_test) | ||
+ | # test na zbiorze testowym: dla kolejnych buforów wejściowych obliczamy wartości wyjściowe | ||
+ | y_est = np.zeros(x.shape) | ||
+ | for i in range(len(x)-N_wej-1): | ||
+ | bufor_wejsciowy = x_test[i:i+N_wej] | ||
+ | y_est[i+N_wej-1] = model.predict(bufor_wejsciowy) | ||
+ | |||
+ | #ilustracja działania dopasowanego modelu na sygnał testowy | ||
+ | py.figure(2) | ||
+ | py.subplot(2,2,1) | ||
+ | py.plot(t,x_test) | ||
+ | py.title(u'wejście') | ||
+ | |||
+ | py.subplot(2,2,3) | ||
+ | py.plot(t,y_est,'r') | ||
+ | py.plot(t,y_test,'g') | ||
+ | py.title(u'wyjście') | ||
+ | |||
+ | py.subplot(2,2,2) | ||
+ | f,P = spectrum(x_test[-sampling:],sampling) | ||
+ | py.stem(f,P) | ||
+ | py.title(u'widmo wejścia') | ||
+ | py.subplot(2,2,4) | ||
+ | f,P = spectrum(y_est[-sampling:],sampling) | ||
+ | py.stem(f,P) | ||
+ | py.title(u'widmo wyjścia') | ||
+ | py.show() | ||
+ | |||
+ | |||
+ | np.set_printoptions(precision =3, suppress = True) | ||
+ | print "Porównanie współczynników" | ||
+ | print "filtr:" | ||
+ | print b | ||
+ | print "model" | ||
+ | print model.coef_ | ||
+ | |||
+ | |||
+ | </source> | ||
+ | <!-- | ||
==Przygotowanie danych == | ==Przygotowanie danych == | ||
Najpierw przygotujemy dane. Dane wejściowe to szum gaussowski, zaś wyjście to przefiltrowany dolnoprzepustowo szum z częstością odcięcia 20Hz. | Najpierw przygotujemy dane. Dane wejściowe to szum gaussowski, zaś wyjście to przefiltrowany dolnoprzepustowo szum z częstością odcięcia 20Hz. | ||
Linia 135: | Linia 256: | ||
</source> | </source> | ||
− | ==Wytworzenie | + | ==Wytworzenie instancji obiektu do regresji i uczenie== |
− | |||
<source lang = python> | <source lang = python> | ||
siec = FeedForwardNetwork() | siec = FeedForwardNetwork() | ||
Linia 230: | Linia 350: | ||
# Proszę sprawdzić działanie sieci w zależności od rozmiaru wejścia | # Proszę sprawdzić działanie sieci w zależności od rozmiaru wejścia | ||
− | + | --> | |
<!-- | <!-- | ||
# -*- coding: utf-8 -*- | # -*- coding: utf-8 -*- |
Wersja z 16:25, 28 gru 2015
Regresja liniowa jako filtr
Poniższy przykład ma nam uświadomić możliwość wykorzystania regresji do filtrowania sygnałów. Przy okazji nauczymy się pracy z ciągiem uczącym
# -*- coding: utf-8 -*-
#from sklearn.neural_network import MLPRegressor #http://scikit-learn.org/dev/modules/generated/sklearn.neural_network.MLPRegressor.html#sklearn.neural_network.MLPRegressor
from sklearn import linear_model
from scipy.signal import firwin, lfilter
import numpy as np
import pylab as py
def spectrum(x,Fs):
N = len(x)
P = np.abs(np.fft.fft(x))**2/len(x)
f = np.fft.fftfreq(len(x),1.0/Fs)
P = P[0:N/2]
P[1:-1] *=2
f = f[0:N/2]
return f,P
sampling = 128.0
rzad = 30
N_wej = rzad # rozmiar bufora wejściowego
demo = False # czy rysować tworzenie przykładów
T = 10 # ile skund sygnału
t = np.arange(0,T,1/sampling)
#Losowy sygnał wejściowy
x = np.random.randn(len(t))
# przygotowujemy dane tak aby nauczyć filtrowania dolnoprzepustowego
b= firwin(rzad,10.0/sampling)
y = lfilter(b,[1],x)
# tworzymy ciąg uczący
N_przykladow = len(x)-N_wej-1
X = np.zeros((N_przykladow,N_wej))
Y = np.zeros((N_przykladow,1))
for i in range(N_przykladow):
X[i,:] = x[i:i+N_wej]
Y[i] = y[i+N_wej-1]
if demo:
py.clf()
py.plot(t,x,'r')
py.plot(t,y,'b')
py.plot(t[i:i+N_wej],X[i,:],'ro')
py.plot(t[i+N_wej-1],Y[i],'bo')
py.pause(1)
# tworzmy obiekt do regersji liniowej
model = linear_model.LinearRegression(fit_intercept=False)
# dopasowujemy parametry modelu
model.fit(X, Y)
# test na zbiorze uczącym: dla kolejnych buforów wejściowych obliczamy wartości wyjściowe
y_est = np.zeros(x.shape)
for i in range(len(x)-N_wej-1):
bufor_wejsciowy = x[i:i+N_wej]
y_est[i+N_wej-1] = model.predict(bufor_wejsciowy)
# ilustracja dopasowania modelu:
# - górny panel sygnał wejściowy
# - dolny panel sygnał otrzymany jako predykcje modelu (czerwony) na tle filtrowanego sygnału (zielony)
py.figure(1)
py.subplot(2,1,1)
py.plot(t,x)
py.title('wejscie')
py.subplot(2,1,2)
py.plot(t,y,'g')
py.plot(t,y_est,'r')
py.title('wyjscie')
# test na innym zbiorze - dajemy zestaw sinusów o losowej fazie i czestosciach 0-64Hz
x_test = np.zeros(len(t))
faza = np.zeros(len(range(1,64,2)))
for i,f in enumerate(range(1,64,2)):
faza[i] = np.random.rand(1)*2*np.pi
x_test += np.sin(2*np.pi*f*t + faza[i])
y_test = lfilter(b,[1],x_test)
# test na zbiorze testowym: dla kolejnych buforów wejściowych obliczamy wartości wyjściowe
y_est = np.zeros(x.shape)
for i in range(len(x)-N_wej-1):
bufor_wejsciowy = x_test[i:i+N_wej]
y_est[i+N_wej-1] = model.predict(bufor_wejsciowy)
#ilustracja działania dopasowanego modelu na sygnał testowy
py.figure(2)
py.subplot(2,2,1)
py.plot(t,x_test)
py.title(u'wejście')
py.subplot(2,2,3)
py.plot(t,y_est,'r')
py.plot(t,y_test,'g')
py.title(u'wyjście')
py.subplot(2,2,2)
f,P = spectrum(x_test[-sampling:],sampling)
py.stem(f,P)
py.title(u'widmo wejścia')
py.subplot(2,2,4)
f,P = spectrum(y_est[-sampling:],sampling)
py.stem(f,P)
py.title(u'widmo wyjścia')
py.show()
np.set_printoptions(precision =3, suppress = True)
print "Porównanie współczynników"
print "filtr:"
print b
print "model"
print model.coef_
Modelowanie i predykcja szeregu czasowego
Załóżmy, że mamy pewien szereg czasowy. Dalej zakładamy, że jest on wynikiem pewnego procesu autoregresyjnego, tzn. że jego kolejna próbka jest pewną kombinacją liniową poprzednich próbek z dodanym szumem:
- [math] x_t = \sum_{i=1}^p a_i x_{t-i} +\epsilon_t[/math]
Czy dałoby się zastosować techniki uczenia sieci neuronowej do oszacowania współczynników [math]a_i[/math]?
- Przy pomocy poniższego kodu proszę wygenerować realizację procesu AR o długości N = 2000 i współczynnikach a = [-0.5, 0.2], epsilon niech będzie = 0.1:
def generujAR(a, epsilon, N):
x=np.zeros(N)
rzad = len(a)
for i in range(rzad,N):
for p in range(len(a)):
x[i] += a[p]*x[i-(p+1)]
x[i] += epsilon*np.random.randn()
return x
- Proszę wykreślić tą realizację
- Skonstruować ciąg uczący gdzie wejściem jest p poprzednich próbek zaś wyjściem kolejna próbka.
- Skonstruuj sieć o ilości wejść równej rzędowi modelu p
- Ucz sieć i obserwuj jak zmieniają się wagi.
- Zbadaj co dzieje się z estymowanymi parametrami oraz błędem popełnianym przez sieć gdy rozmiar wejścia nie jest zgodny z rzędem modelu.
# -*- coding: utf-8 -*-
from pybrain.structure import FeedForwardNetwork, LinearLayer, FullConnection
from pybrain.supervised.trainers import BackpropTrainer
from pybrain.datasets import SupervisedDataSet
from scipy.signal import firwin, lfilter
import numpy as np
import pylab as py
def generujAR(a, epsilon, N):
x=np.zeros(N)
rzad = len(a)
for i in range(rzad,N):
for p in range(len(a)):
x[i] += a[p]*x[i-(p+1)]
x[i] += epsilon*np.random.randn()
return x
N = 2000
x = np.zeros(N)
a = np.array([ -0.5, 0.2]) #[0.1 -0.2 0.3 0.1 -0.1]
epsilon =0.1
x = generujAR(a,epsilon,N)
py.plot(x)
py.show()
# tworzymy ciąg uczący CU
N_wej = 2
CU = SupervisedDataSet(N_wej, 1)
for i in range(len(x)-N_wej-1):
bufor_wejsciowy = x[i:i+N_wej]
wartosc_wyjsciowa = x[i+N_wej]
CU.addSample( bufor_wejsciowy[::-1], wartosc_wyjsciowa)#
# wytwarzamy pustą sieć
siec = FeedForwardNetwork()
# tworzymy węzły wejściowe i wyjściowe
warstwaWejsciowa = LinearLayer(N_wej)
warstwaWyjsciowa = LinearLayer(1)
# dodajemy węzły do sieci
siec.addInputModule(warstwaWejsciowa)
siec.addOutputModule(warstwaWyjsciowa)
# łączymy węzły
wej_do_wyj = FullConnection(warstwaWejsciowa, warstwaWyjsciowa)
siec.addConnection(wej_do_wyj)
# inicjujemy strukturę sieci
siec.sortModules()
trainer = BackpropTrainer(siec, CU,learningrate=0.01, momentum=0.8,verbose=True)
#trainer.trainUntilConvergence(maxEpochs = 500)
for i in range(10):
trainer.trainEpochs(1)
print i, siec.params
# test na zbiorze uczącym
y_est = np.zeros(x.shape)
for i in range(len(x)-N_wej-1):
bufor_wejsciowy = x[i:i+N_wej]
y_est[i+N_wej] = siec.activate(bufor_wejsciowy[::-1])
#py.plot(t,x)
py.subplot(2,1,1)
py.plot(x,'b')
py.plot(y_est,'r')
py.subplot(2,1,2)
py.plot(x-y_est)
print 'wariancja reziduum, ', np.var(x-y_est)
print 'wariancja procesu AR, ', epsilon**2
print 'parametry procesu: ', str(a)
print 'parametry wyestymowane: ', str(siec.params)
py.show()