EEG/Pracownia EEG/SSVEP 2: Różnice pomiędzy wersjami

Z Brain-wiki
(Utworzono nową stronę "=Koncepcja drgania uogólnionego. Transformata Hilberta= ==Wstęp== Sygnałem najczęściej występującym w przyrodzie oraz najczęściej stosowanym w technice jest syg...")
 
Linia 2: Linia 2:
 
==Wstęp==
 
==Wstęp==
 
Sygnałem najczęściej występującym w przyrodzie oraz najczęściej stosowanym w technice jest sygnał harmoniczny o postaci:
 
Sygnałem najczęściej występującym w przyrodzie oraz najczęściej stosowanym w technice jest sygnał harmoniczny o postaci:
<equation>
+
 
 
<math>x(t) = A \sin(\omega t + \varphi_0)</math>
 
<math>x(t) = A \sin(\omega t + \varphi_0)</math>
</equation>
 
 
gdzie: <br>
 
gdzie: <br>
 
<math>t</math> &mdash; chwila czasu <br>
 
<math>t</math> &mdash; chwila czasu <br>
Linia 12: Linia 11:
  
 
Okazuje się, że istnieje szeroka klasa sygnałów rzeczywistych, które można przedstawić w postaci tzw. drgania uogólnionego:
 
Okazuje się, że istnieje szeroka klasa sygnałów rzeczywistych, które można przedstawić w postaci tzw. drgania uogólnionego:
<equation>
 
 
<math>x(t) = A(t) \sin(\Omega(t)\cdot t)</math>
 
<math>x(t) = A(t) \sin(\Omega(t)\cdot t)</math>
</equation>
 
  
 
gdzie: <br>
 
gdzie: <br>
Linia 24: Linia 21:
 
W celu przedstawienia sygnału <math>x(t)</math> jako drgania uogólnionego należy wpierw wyznaczyć jego ''sygnał analityczny'' ''z''(''t''), który zdefiniowany jest w następujący sposób:
 
W celu przedstawienia sygnału <math>x(t)</math> jako drgania uogólnionego należy wpierw wyznaczyć jego ''sygnał analityczny'' ''z''(''t''), który zdefiniowany jest w następujący sposób:
  
<equation>
 
 
<math>z(t) = x(t) + ix_H(t)\;</math>
 
<math>z(t) = x(t) + ix_H(t)\;</math>
</equation>
 
  
 
gdzie: <br>
 
gdzie: <br>
Linia 33: Linia 28:
  
 
Transformatę Hilberta <math>x_H(t)</math> sygnału <math>x(t)</math> i transformatę do niej odwrotną definiujemy jak poniżej:
 
Transformatę Hilberta <math>x_H(t)</math> sygnału <math>x(t)</math> i transformatę do niej odwrotną definiujemy jak poniżej:
<equation>
 
 
<math>
 
<math>
 
x_H(t) = \frac{1}{\pi}\int_{-\infty}^{\infty} \frac{x(\tau)}{t - \tau}d\tau
 
x_H(t) = \frac{1}{\pi}\int_{-\infty}^{\infty} \frac{x(\tau)}{t - \tau}d\tau
 
</math>
 
</math>
</equation>
 
 
<br>
 
<br>
<equation>
 
 
<math>
 
<math>
 
x(t) = -\frac{1}{\pi}\int_{-\infty}^{\infty} \frac{x_H(\tau)}{t - \tau}d\tau
 
x(t) = -\frac{1}{\pi}\int_{-\infty}^{\infty} \frac{x_H(\tau)}{t - \tau}d\tau
 
</math>
 
</math>
</equation>
 
  
 
  '''Uwaga praktyczna:'''  
 
  '''Uwaga praktyczna:'''  
Linia 54: Linia 45:
 
   
 
   
 
Jak można zauważyć, sygnał analityczny jest funkcją zespoloną, w związku z czym można go przedstawić w postaci:
 
Jak można zauważyć, sygnał analityczny jest funkcją zespoloną, w związku z czym można go przedstawić w postaci:
<equation>
 
 
<math>
 
<math>
 
z(t) = \left|z(t)\right|e^{i\varphi(t)}
 
z(t) = \left|z(t)\right|e^{i\varphi(t)}
 
</math>
 
</math>
</equation>
 
 
gdzie (patrz równanie (3)):<br>
 
gdzie (patrz równanie (3)):<br>
 
<math>
 
<math>
Linia 80: Linia 69:
  
 
co umożliwia przedstawienie sygnału ''x''(''t'') w postaci drgania uogólnionego:
 
co umożliwia przedstawienie sygnału ''x''(''t'') w postaci drgania uogólnionego:
<equation>
 
 
<math>x(t) = A(t) \sin(\Omega(t)\cdot t)</math>
 
<math>x(t) = A(t) \sin(\Omega(t)\cdot t)</math>
</equation>
 
  
 
Porównując powyższy wzór ze wzorem na funkcję harmoniczną:
 
Porównując powyższy wzór ze wzorem na funkcję harmoniczną:
<equation>
 
 
<math>x(t) = A \sin(\omega t + \varphi_0)</math>
 
<math>x(t) = A \sin(\omega t + \varphi_0)</math>
</equation>
 
  
 
widzimy, że sygnały nieharmoniczne charakteryzują się zmienną w czasie amplitudą i częstością oraz nie mają określonej fazy początkowej. Ten ostatni parametr jednak również może być wyznaczony, pod warunkiem iż określimy go względem pewnej stałej w czasie częstości &omega;<sub>0</sub>(''t''):
 
widzimy, że sygnały nieharmoniczne charakteryzują się zmienną w czasie amplitudą i częstością oraz nie mają określonej fazy początkowej. Ten ostatni parametr jednak również może być wyznaczony, pod warunkiem iż określimy go względem pewnej stałej w czasie częstości &omega;<sub>0</sub>(''t''):
<equation>
 
 
<math>\varphi(t)=\omega_0\cdot t + \varphi_0(t)</math>
 
<math>\varphi(t)=\omega_0\cdot t + \varphi_0(t)</math>
</equation>
 
 
gdzie: <br>
 
gdzie: <br>
 
<math>\varphi_0(t)</math> &mdash; faza chwilowa sygnału <math>x(t)</math>.<br>
 
<math>\varphi_0(t)</math> &mdash; faza chwilowa sygnału <math>x(t)</math>.<br>

Wersja z 19:35, 23 maj 2015

Koncepcja drgania uogólnionego. Transformata Hilberta

Wstęp

Sygnałem najczęściej występującym w przyrodzie oraz najczęściej stosowanym w technice jest sygnał harmoniczny o postaci:

[math]x(t) = A \sin(\omega t + \varphi_0)[/math] gdzie:
[math]t[/math] — chwila czasu
[math]A[/math] — amplituda sygnału,
ω — częstość sygnału,
φ[math]_0[/math] — faza początkowa sygnału.

Okazuje się, że istnieje szeroka klasa sygnałów rzeczywistych, które można przedstawić w postaci tzw. drgania uogólnionego: [math]x(t) = A(t) \sin(\Omega(t)\cdot t)[/math]

gdzie:
[math]t[/math] — chwila czasu
[math]A(t)[/math] — amplituda chwilowa sygnału x(t) (jego obwiednia),
Ω(t) — częstość chwilowa sygnału x(t),

Do klasy sygnałów, które mogą być reprezentowane w postaci drgania uogólnionego, należą m.in. wszystkie sygnały o ograniczonej energii i ograniczonej mocy średniej przedziałami ciągłe i bez składowej stałej (tzw. sygnały przestrzeni [math]L^2[/math]). W celu przedstawienia sygnału [math]x(t)[/math] jako drgania uogólnionego należy wpierw wyznaczyć jego sygnał analityczny z(t), który zdefiniowany jest w następujący sposób:

[math]z(t) = x(t) + ix_H(t)\;[/math]

gdzie:
[math]i=\sqrt{-1}[/math]
[math]x_H(t)[/math] — transformata Hilberta sygnału [math]x(t)[/math].

Transformatę Hilberta [math]x_H(t)[/math] sygnału [math]x(t)[/math] i transformatę do niej odwrotną definiujemy jak poniżej: [math] x_H(t) = \frac{1}{\pi}\int_{-\infty}^{\infty} \frac{x(\tau)}{t - \tau}d\tau [/math]
[math] x(t) = -\frac{1}{\pi}\int_{-\infty}^{\infty} \frac{x_H(\tau)}{t - \tau}d\tau [/math]

Uwaga praktyczna: 
do wyznaczania sygnału analitycznego korzysta się z jego następującej własności:
Widmo sygnału analitycznego odpowiadającego sygnałowi rzeczywistemu jest zerowe 
dla ujemnych częstości, zaś dla dodatnich częstości ma podwojoną amplitudę:
[math]x_a = F^{-1}\left(F(x)\cdot 2U\right)[/math]
gdzie F — transformacja Fouriera, a U funkcja schodkowa.
Metoda ta zaimplementowana jest w funkcji scipy.signal.hilbert

Jak można zauważyć, sygnał analityczny jest funkcją zespoloną, w związku z czym można go przedstawić w postaci: [math] z(t) = \left|z(t)\right|e^{i\varphi(t)} [/math] gdzie (patrz równanie (3)):
[math] \begin{array}{l} \left|z(t)\right| = \sqrt{x^2(t) + x^2_H(t)} \\ \\ \varphi(t) = \mathrm{arc\,tg}(\frac{x_H(t)}{x(t)}) \end{array} [/math]

Wielkości te służą do wyznaczania chwilowej fazy φ (wzór powyżej), chwilowej amplitudy A (obwiedni) oraz chwilowej częstości Ω sygnału [math]x(t)[/math]:

[math] \begin{array}{l} A(t)=\left|z(t)\right| \\ \\ \Omega(t) = \frac{d\varphi(t)}{dt} \end{array} [/math]

co umożliwia przedstawienie sygnału x(t) w postaci drgania uogólnionego: [math]x(t) = A(t) \sin(\Omega(t)\cdot t)[/math]

Porównując powyższy wzór ze wzorem na funkcję harmoniczną: [math]x(t) = A \sin(\omega t + \varphi_0)[/math]

widzimy, że sygnały nieharmoniczne charakteryzują się zmienną w czasie amplitudą i częstością oraz nie mają określonej fazy początkowej. Ten ostatni parametr jednak również może być wyznaczony, pod warunkiem iż określimy go względem pewnej stałej w czasie częstości ω0(t): [math]\varphi(t)=\omega_0\cdot t + \varphi_0(t)[/math] gdzie:
[math]\varphi_0(t)[/math] — faza chwilowa sygnału [math]x(t)[/math].

Faza chwilowa jest zatem zdefiniowana jednoznacznie, ale tylko względem określonej częstości [math]\omega_0[/math]. W przypadku gdy analizujemy sygnały szerokopasmowe, wyznaczenie fazy chwilowej jest możliwe po przefiltrowaniu sygnału filtrem pasmowo-przepustowym.

Ćwiczenia symulacyjne

Proszę zaimplementować funkcje generujące następujące przebiegi czasowe (oznaczenia: Fs — częstość próbkowania, T — czas trwania w sekundach, analogicznie do tego):

  • sinusoida o zadanej częstości f i fazie [math]\phi[/math]: y = sin(f, phi, Fs, T),
  • funkcja Gabora o zadanym położeniu szerokości i częstości y = gabor(t0, sigma, omega, Fs, T):
[math]g_1(t) = \exp\left(-\frac{(t-t_0)^2}{2 \sigma^2}\right)\cdot \cos\left(\omega(t-t_0) \right)[/math].

Ćwiczenie 1

  • Wygeneruj 2-sekundowy odcinek sygnału Gabora o pozycji w czasie t0 = 1 s, częstości 16 Hz, skali 0,1 s i częstości próbkowania 128 Hz.
  • Wyznacz i narysuj amplitudę chwilową sygnału Gabora.

Ćwiczenie 2

  • Wyznacz i narysuj amplitudę chwilową sygnału sinusoidalnego, o częstości 16 Hz i częstości próbkowania 128 Hz.
  • Wyznacz i narysuj fazę chwilową sygnału sinusoidalnego, korzystając ze związku:

No reference identifier provided

Ćwiczenie 3

Wygeneruj dwa sygnały sinusoidalne o tej samej częstości 32 Hz i częstości próbkowania 128 Hz, ale różnych fazach początkowych. Pierwszy sygnał powinien mieć fazę początkową równą 0, drugi sygnał sinusoidalny powinien mieć fazę początkową równą π/4. Za pomocą transformaty Hilberta wyznacz różnicę faz symulowanych sygnałów.

Ćwiczenie 4

To ćwiczenie jest ku przestrodze. Wytwórz sygnał będący sumą dwóch sinusoid: jednej o częstości 30 i drugiej o częstości 32 Hz. Wykreśl przebieg sygnału i jego amplitudy chwilowej.


Ćwiczenia na danych pomiarowych

Ćwiczenie 1

W zebranych sygnałach SSVEP wybierz zapisy dla trzech różnych częstości stymulacji (po jednym dla każdej częstości). Do analizy wybierz trzy kanały EEG, dla których sygnał SSVEP jest a) bardzo wyraźny; b) widoczny, ale słabszy; c) w zasadzie niewidoczny. Do analizy wybierz fragmenty od 2 sekund przed rozpoczęciem stymulacji do 2 sekund po jej zakończeniu.

Dla każdej wybranej częstości stymulacji wybrane kanały EEG przefiltruj filtrem wąskopasmowym przepuszczającym częstości skupione wokół tej częstości stymulacji. Do przefiltrowanych sygnałów zastosuj transformację Hilberta, wyznacz amplitudę i częstość chwilową. Wyznacz fazę chwilową dla ω0 równej częstości stymulacji. Wypróbuj dwa sposoby filtrowania: „w jedną stronę” (filter) i „w obie strony” (filtfilt).

Wyrysuj przefiltrowane sygnały wraz z wyliczoną amplitudą chwilową. Do rysunku dodaj wykres sygnału triggera aby widać było początek i koniec stymulacji. Narysuj też wykres zależności częstości chwilowej i fazy chwilowej od czasu.