TI/Pracownia wykorzystania zasobów internetowych/PUBMED

Z Brain-wiki

Zadanie 1

Wejdź na stronę główną bazy PubMed (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed). Zarejestruj się i zaloguj do My NCBI (kliknij na My NCBI na górnym pasku po prawej stronie).

Zadanie 2

Dowiedziałaś/eś się, w jednym z wydań czasopisma BMJ można znaleźć artykuł, porównujący korzyści zdrowotne wynikające z picia martini wstrząśniętego (shaken) lub mieszanego (stirred). Znajdź ten artkuł. Posłuż się opcją Single Citation Matcher.(strona główna => PubMed Tools)

Zadanie 3

Znajdź pełny tytuł czasopisma BBRC. Kto jest jego wydawcą, jak często się ukazuje, w którym roku ukazało się pierwsze wydanie? Wskazówka: znajdź jakikolwiek artykuł w tym czasopiśmie, wpisując BBRC w okienku wyszukiwarki; ze strony z wynikami wyszukiwania przejdź do strony informacyjnej dotyczącej tego artykułu, kliknij lewym klawiszem myszy na nazwę czasopisma i wybierz NLM Catalog.

Zadanie 4

Znajdź artykuły, których autorem jest S. R. Kimball. Jaka jest jego afiliacja?

Zadanie 5

Znajdź odnośniki do artykułów o Jamesie D Watsonie. Skorzystaj z tagu Personal name as subject. Wyeliminuj wszystkie pozycje, których autorem jest Watson. Wybierz następnie kilka pozycji, które są dla ciebie interesujące i umieść je w schowku (Sent to => Clipbord). Możesz skorzystać z Search Builder w Advance Search lub wpisać frazy z odpowiednimi tagami ([…]) i kwantyfikatorami logicznymi (AND, OR, NOT). Pełną listę tagów i opis odpowiadających im obszarów znajdziesz w PubMed Help w zakładce Search Field Descriptions and Tags.

Zadanie 6

Znajdź artykuły w BBRC, których autorem jest S. R. Kimball. Wykorzystaj historię wyszukiwania (Search History w Advanced Search). Używając filtru, wyszukaj artykuły przeglądowe (Filter your Results => Review) i utwórz zawierającą je nową kolekcję w My NCBI (użyj opcji Sent to => Collections). Nadaj jej odpowiednią nazwę.

Zadanie 7

Znajdź artykuły S. R. Kimballa, które ukazały się po 2007 roku (opcja Limits) i zawierające w tytule lub abstrakcie termin mRNA. Dodaj je do kolekcji utworzonej w zadaniu 6.

Zadanie 8

  1. W jednym wyszukiwaniu znajdź cytowania dotyczące białka GFP (Green Fluorescent Protein) i procesu tworzenia struktury trzeciorzędowej białek (protein folding). Obejrzyj w jaki sposób zostało przeprowadzone wyszukiwanie (Search Details).
  2. Przeprowadź analogiczne wyszukiwanie używając MeSH Database do konstrukcji zapytania (również przy ograniczeniu do Major Topic headings only).
  3. Spośród cytowań znalezionych w punkcie B wybierz te, które powstały w placówkach naukowych mających swą siedzibę w Nowym Yorku (ogranicz wyszukiwanie do odpowiedniej dziedziny — box Field w Advanced Search lub zastosuj odpowiedni tag). Zapisz wynik wyszukiwania w My NCBI (Save search) oraz stwórz plik tekstowy zawierający spis cytowań (użyj funkcji Sent to => File).
  4. Wybierz trzy odnośniki z punktu B i wyślij je do siebie poprzez e-mail (Sent to => E-mail) w formacie, który zawiera abstrakty.

Zadanie 9

Wykorzystując PubMed, Wirtualną Biblitekę Nauki oraz Bibliotekę UW, postaraj się znaleźć pełne teksty odnośników znalezionych w zadaniu 8 C.

Zadanie 10

Znajdź pełne teksty artykułów przeglądowych dotyczących białka GFP, które ukazały się w czasopiśmie Science.