Pracownia EEG: Różnice pomiędzy wersjami
Z Brain-wiki
| (Nie pokazano 13 pośrednich wersji utworzonych przez tego samego użytkownika) | |||
| Linia 4: | Linia 4: | ||
==Terminy== | ==Terminy== | ||
| − | Zajęcia odbywają się | + | Zajęcia odbywają się w sali 4.59 w budynku Pasteura 5. |
| − | * we wtorki w godz. | + | * we wtorki w godz. 10:30 - 13:45 |
| − | * w | + | * w środy w godz. 13:15 - 16:30 |
| + | |||
| + | <b>Uwaga:</b> ze względu na godziny dziekańskie w dniu 04.10.2022 zajęcia z Pracowni EEG zaczniemy w środę 05.10.2022. | ||
==Materiały== | ==Materiały== | ||
| Linia 15: | Linia 17: | ||
#[[Pracownia_EEG/SSVEP_1|SSVEP]] | #[[Pracownia_EEG/SSVEP_1|SSVEP]] | ||
#[[Pracownia_EEG/AR_1|Widmowa analiza parametryczna]] | #[[Pracownia_EEG/AR_1|Widmowa analiza parametryczna]] | ||
| − | #[[Pracownia_EEG/analiza_obrazu|Wstęp do analizy obrazu]] | + | <!--#[[Pracownia_EEG/analiza_obrazu|Wstęp do analizy obrazu]] |
| − | #[[Pracownia_EEG/ERDS_2|Wprowadzenie do metod czas-częstość]] | + | -->#[[Pracownia_EEG/ERDS_2|Wprowadzenie do metod czas-częstość]] |
#[[Pracownia_EEG/ERDS|Synchronizacja i desynchronizacja sygnału EEG związana z bodźcem]] | #[[Pracownia_EEG/ERDS|Synchronizacja i desynchronizacja sygnału EEG związana z bodźcem]] | ||
| − | #[[Pracownia_EEG/Zagadnienia_dodatkowe|Zagadnienia dodatkowe]] | + | <!--#[[Pracownia_EEG/Zagadnienia_dodatkowe|Zagadnienia dodatkowe]] |
| − | + | --> | |
Autorzy: dr hab. Maciej Kamiński, | Autorzy: dr hab. Maciej Kamiński, | ||
dr Rafał Kuś, | dr Rafał Kuś, | ||
| Linia 28: | Linia 30: | ||
Materiał zajęć jest podzielony na bloki tematyczne. W każdym bloku studenci mają do wykonania zestaw ćwiczeń. | Materiał zajęć jest podzielony na bloki tematyczne. W każdym bloku studenci mają do wykonania zestaw ćwiczeń. | ||
Zaliczenie bloku ma dwa elementy: | Zaliczenie bloku ma dwa elementy: | ||
| − | |||
| − | |||
| − | + | * prezentacja - każda osoba z grupy przygotowuje prezentację dotyczącą jednego zagadnienia losowanego spośród występujących w danym bloku tematycznym. | |
| + | |||
| + | * raport - krótki opis wykonanego ćwiczenia przygotowany według załączonego wzorca. Każda osoba opisuje ćwiczenie, które wcześniej prezentowała. Termin złożenia raportu jest do tygodnia po prezentacji. | ||
| + | |||
| + | === Terminy prezentacji === | ||
| + | Prezentacje z pierwszej części ćwiczeń odbędą się na zajęciach we wtorek 14.11.2023 i w środę 22.11.2023. | ||
| + | |||
| + | Zagadnienia do omówienia: | ||
| + | |||
| + | # Charakterystyka artefaktów w sygnale EEG. | ||
| + | # Funkcja autokowariancji i autokorelacji dla sygnałów z oczu otwartych i zamkniętych, omówienie różnic między nimi. Oszacowanie możliwego opóźnienia rytmu alfa w mierzonych sygnałach. | ||
| + | # Korelacje wzajemne dla sygnałów z oczu otwartych i zamkniętych, omówienie różnic między nimi. Oszacowanie możliwego opóźnienia rytmu alfa w mierzonych sygnałach. | ||
| + | # Omówienie statystyki służącej do oceny istotności korelacji, wyniki. | ||
| + | # Związek autokorelacji i korelacji wzajemnej z widmem; wyniki dla sygnałów w zakresie 0-40 Hz — amplituda i faza. Oszacowanie możliwego opóźnienia rytmu alfa w mierzonych sygnałach na podstawie przesunięcia fazowego. | ||
| + | # Związek autokorelacji i korelacji wzajemnej z widmem; wyniki dla sygnałów w zakresie 8-12 Hz — amplituda i faza. Oszacowanie możliwego opóźnienia rytmu alfa w mierzonych sygnałach na podstawie przesunięcia fazowego. | ||
| + | # Omówienie zadania 5. | ||
| + | <!-- | ||
| + | Tematy:<br> | ||
| + | # Artefakty, funkcje kowariancji i korelacji własnej i wzajemnej, właściwości. Przykładowe wyniki dla danych z oczu otwartych i zamkniętych, filtrowanych i niefiltrowanych. | ||
| + | # Macierz korelacji wybranych kanałów EEG w różnych sytuacjach. Statystyka do oceny istotności wyników. Oszacowanie opóźnienia. | ||
| + | # Związek korelacji z widmem. Macierz gęstości widmowych wybranych kanałów EEG. Amplituda i faza. Porównanie z widmem Welcha. Oszacowanie opóźnienia z przesunięcia fazowego. | ||
| + | <br><br> | ||
| + | Prezentacje z drugiej części ćwiczeń odbędą się na zajęciach we wtorek 06.12.2022.<br> | ||
| + | Tematy:<br> | ||
| + | # Sygnały symulowane — uśrednianie w modelu addytywnym i z fluktuacją latencji. Wpływ referencji na amplitudę P300 | ||
| + | # Omówienie metod statystycznych (resamplingowej i analitycznej). Porównanie estymowania amplitudy P100 a istotność statystyczna. | ||
| + | # Sygnały symulowane — uśrednianie z resetem fazy. Wpływ filtrów. Usuwanie artefaktów ręcznie lub za pomocą progu. | ||
| + | <br><br> | ||
| + | Prezentacje z trzeciej części ćwiczeń odbędą się na zajęciach we wtorek 10.01.2023.<br> | ||
| + | Tematy:<br> | ||
| + | # Omówienie trzech metod estymacji widma sygnałów SSVEP | ||
| + | # Zbieranie danych SSVEP. Krzywa odpowiedzi SSVEP w zależności od częstości | ||
| + | # Transformacja Hilberta. Zastosowanie do sygnałów rzeczywistych. | ||
| + | --> | ||
| + | Prezentacje z drugiej części ćwiczeń będą polegały na wybraniu do omówienia przez każdą osobę jednego tematu z części symulacyjnej i części eksperymentalnej. | ||
| + | |||
| + | Zagadnienia do części symulacyjnej: | ||
| + | |||
| + | # Uśrednianie w modelu addytywnym: sygnał + szum. | ||
| + | # Uśrednianie w modelu addytywnym: sygnał + szum + niezależna czynność rytmiczna. | ||
| + | # Uśrednianie w modelu z resetem fazy. | ||
| + | # Uśrednianie potencjału z fluktuacją latencji. | ||
| + | # Wpływ filtrów. | ||
| + | |||
| + | Zagadnienia do części eksperymentalnej: | ||
| + | |||
| + | # Zależność załamków potencjałów wzrokowych od intensywności bodźca. | ||
| + | # Zależność późnych załamków od uwagi. | ||
| + | |||
===Wskazówki dotyczące przygotowania raportu=== | ===Wskazówki dotyczące przygotowania raportu=== | ||
| − | + | Raport przygotowujemy w środowisku LaTex, korzystając z [https://drive.google.com/file/d/173TL7f5-VN83ijjJYPBaiOx96N6nokOb/view?usp=sharing podanego tutaj wzorca]. | |
| − | |||
<!-- | <!-- | ||
=====Wstęp===== | =====Wstęp===== | ||
Aktualna wersja na dzień 11:32, 5 gru 2023
Pracownia EEG
Terminy
Zajęcia odbywają się w sali 4.59 w budynku Pasteura 5.
- we wtorki w godz. 10:30 - 13:45
- w środy w godz. 13:15 - 16:30
Uwaga: ze względu na godziny dziekańskie w dniu 04.10.2022 zajęcia z Pracowni EEG zaczniemy w środę 05.10.2022.
Materiały
- EEG spoczynkowe, artefakty
- Własności EEG spoczynkowego: funkcja autokorelacji i widmo
- Potencjały wywołane
- SSVEP
- Widmowa analiza parametryczna
- Wprowadzenie do metod czas-częstość
- Synchronizacja i desynchronizacja sygnału EEG związana z bodźcem
Autorzy: dr hab. Maciej Kamiński, dr Rafał Kuś, dr hab. Jarosław Żygierewicz
Zasady zaliczenia pracowni
Materiał zajęć jest podzielony na bloki tematyczne. W każdym bloku studenci mają do wykonania zestaw ćwiczeń. Zaliczenie bloku ma dwa elementy:
- prezentacja - każda osoba z grupy przygotowuje prezentację dotyczącą jednego zagadnienia losowanego spośród występujących w danym bloku tematycznym.
- raport - krótki opis wykonanego ćwiczenia przygotowany według załączonego wzorca. Każda osoba opisuje ćwiczenie, które wcześniej prezentowała. Termin złożenia raportu jest do tygodnia po prezentacji.
Terminy prezentacji
Prezentacje z pierwszej części ćwiczeń odbędą się na zajęciach we wtorek 14.11.2023 i w środę 22.11.2023.
Zagadnienia do omówienia:
- Charakterystyka artefaktów w sygnale EEG.
- Funkcja autokowariancji i autokorelacji dla sygnałów z oczu otwartych i zamkniętych, omówienie różnic między nimi. Oszacowanie możliwego opóźnienia rytmu alfa w mierzonych sygnałach.
- Korelacje wzajemne dla sygnałów z oczu otwartych i zamkniętych, omówienie różnic między nimi. Oszacowanie możliwego opóźnienia rytmu alfa w mierzonych sygnałach.
- Omówienie statystyki służącej do oceny istotności korelacji, wyniki.
- Związek autokorelacji i korelacji wzajemnej z widmem; wyniki dla sygnałów w zakresie 0-40 Hz — amplituda i faza. Oszacowanie możliwego opóźnienia rytmu alfa w mierzonych sygnałach na podstawie przesunięcia fazowego.
- Związek autokorelacji i korelacji wzajemnej z widmem; wyniki dla sygnałów w zakresie 8-12 Hz — amplituda i faza. Oszacowanie możliwego opóźnienia rytmu alfa w mierzonych sygnałach na podstawie przesunięcia fazowego.
- Omówienie zadania 5.
Prezentacje z drugiej części ćwiczeń będą polegały na wybraniu do omówienia przez każdą osobę jednego tematu z części symulacyjnej i części eksperymentalnej.
Zagadnienia do części symulacyjnej:
- Uśrednianie w modelu addytywnym: sygnał + szum.
- Uśrednianie w modelu addytywnym: sygnał + szum + niezależna czynność rytmiczna.
- Uśrednianie w modelu z resetem fazy.
- Uśrednianie potencjału z fluktuacją latencji.
- Wpływ filtrów.
Zagadnienia do części eksperymentalnej:
- Zależność załamków potencjałów wzrokowych od intensywności bodźca.
- Zależność późnych załamków od uwagi.
Wskazówki dotyczące przygotowania raportu
Raport przygotowujemy w środowisku LaTex, korzystając z podanego tutaj wzorca.
Wskazówki dotyczące przygotowania prezentacji
- Wyniki ćwiczeń przedstawiamy w postaci prezentacji komputerowej (OpenOffice, PowerPoint, LibreOffice, Acrobat, itp.); czas trwania — maksymalnie 15 minut.
- Należy uwzględnić wyniki uzyskane w ćwiczeniach wskazanych przez prowadzących.
- Należy zadbać o prawidłową postać wykresów, w tym w szczególności:
- obecność opisów osi (w miarę możliwości);
- spójne zakresy osi i skalowanie wykresów;
- właściwy dobór skali (tak, aby uwidocznić najważniejsze rzeczy);
- obecność tytułów i innych podpisów ułatwiających zrozumienie prezentowanych treści.
- Prezentacja wyników powinna uwzględniać:
- przypomnienie co było liczone (i jak, jeśli trzeba);
- na co należy zwrócić uwagę w prezentowanych wynikach;
- interpretację wykresów.
Część z tych informacji można dołożyć do rysunków w postaci krótkich wyjaśnień.
- Ocenie podlegają:
- kompletność prezentacji;
- czytelność prezentowanych wielkości i zjawisk;
- merytoryczna poprawność wypowiedzi.
- Każdy z powyższych elementów prezentacji będzie oceniany w 10-punktowej skali. Punkty zebrane w ciągu semestru będą przekładać się na ocenę końcową.
- Wyniki dodatkowe, ponadprogramowe, są mile widziane i mogą skutkować lepszą oceną.
